Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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Smim11aQ99J19 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim11aQ99J19 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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