Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Ctu1Q99J10 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Ctu1Q99J10 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Ctu1Q99J10 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Ctu1Q99J10 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Ctu1Q99J10 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Ctu1Q99J10 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Ctu1Q99J10 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctu1Q99J10 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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