Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms