Protein–RNA interactions for Protein: Q923U0

Tom1l1, TOM1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1l1Q923U0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tom1l1Q923U0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tom1l1Q923U0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tom1l1Q923U0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tom1l1Q923U0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tom1l1Q923U0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tom1l1Q923U0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tom1l1Q923U0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tom1l1Q923U0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tom1l1Q923U0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tom1l1Q923U0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tom1l1Q923U0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tom1l1Q923U0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tom1l1Q923U0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tom1l1Q923U0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tom1l1Q923U0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tom1l1Q923U0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tom1l1Q923U0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tom1l1Q923U0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms