Protein–RNA interactions for Protein: Q923S6

Neurl1, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1Q923S6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Neurl1Q923S6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms