Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Pde6cQ91ZQ1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pde6cQ91ZQ1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
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Pde6cQ91ZQ1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
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Pde6cQ91ZQ1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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