Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Basp1Q91XV3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Basp1Q91XV3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms