Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms