Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsmce2Q91VT1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms