Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms