Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms