Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul7Q8VE73 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms