Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Smg8Q8VE18 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Smg8Q8VE18 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Smg8Q8VE18 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Smg8Q8VE18 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Smg8Q8VE18 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Smg8Q8VE18 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Smg8Q8VE18 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Smg8Q8VE18 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Smg8Q8VE18 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Smg8Q8VE18 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Smg8Q8VE18 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Smg8Q8VE18 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smg8Q8VE18 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms