Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med17Q8VCD5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms