Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc58Q8R3Q6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms