Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms