Protein–RNA interactions for Protein: Q8R317

Ubqln1, Ubiquilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln1Q8R317 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ubqln1Q8R317 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ubqln1Q8R317 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ubqln1Q8R317 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ubqln1Q8R317 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ubqln1Q8R317 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ubqln1Q8R317 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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