Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J2

Ebf4, Transcription factor COE4, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf4Q8K4J2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms