Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MyripQ8K3I4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms