Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk5rap2Q8K389 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk5rap2Q8K389 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms