Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sash3Q8K352 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms