Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms