Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms