Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms