Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx5Q8K1E0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms