Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbrd1Q8K0B2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms