Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh2d5Q8JZW5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms