Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LgsnQ8CIX8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms