Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TwnkQ8CIW5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms