Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
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Card11Q8CIS0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Card11Q8CIS0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Card11Q8CIS0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Card11Q8CIS0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Card11Q8CIS0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Card11Q8CIS0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Card11Q8CIS0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Card11Q8CIS0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Card11Q8CIS0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Card11Q8CIS0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Card11Q8CIS0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Card11Q8CIS0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Card11Q8CIS0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Card11Q8CIS0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Card11Q8CIS0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Card11Q8CIS0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Card11Q8CIS0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Card11Q8CIS0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Card11Q8CIS0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Card11Q8CIS0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Card11Q8CIS0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Card11Q8CIS0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Card11Q8CIS0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Card11Q8CIS0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Card11Q8CIS0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Card11Q8CIS0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Card11Q8CIS0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Card11Q8CIS0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Card11Q8CIS0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Card11Q8CIS0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Card11Q8CIS0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms