Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Setd1bQ8CFT2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Setd1bQ8CFT2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms