Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms