Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc17Q8CE13 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms