Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDS7

Uncharacterized protein C21orf140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CDS7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8CDS7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8CDS7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8CDS7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8CDS7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8CDS7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8CDS7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8CDS7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8CDS7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8CDS7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8CDS7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8CDS7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8CDS7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8CDS7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8CDS7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8CDS7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CDS7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CDS7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CDS7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CDS7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CDS7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CDS7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CDS7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CDS7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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