Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Lrif1Q8CDD9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Lrif1Q8CDD9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Lrif1Q8CDD9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Lrif1Q8CDD9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Lrif1Q8CDD9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Lrif1Q8CDD9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Lrif1Q8CDD9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Lrif1Q8CDD9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrif1Q8CDD9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms