Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms