Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spef2Q8C9J3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spef2Q8C9J3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms