Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe22Q8C6A8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms