Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C5C9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8C5C9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8C5C9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C5C9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C5C9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C5C9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q8C5C9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms