Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccser1Q8C0C4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms