Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc169Q8BXX9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc169Q8BXX9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc169Q8BXX9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc169Q8BXX9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc169Q8BXX9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc169Q8BXX9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc169Q8BXX9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc169Q8BXX9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc169Q8BXX9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc169Q8BXX9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc169Q8BXX9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc169Q8BXX9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc169Q8BXX9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc169Q8BXX9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc169Q8BXX9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms