Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA0

Lrfn5, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn5Q8BXA0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms