Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall4Q8BX22 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms