Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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