Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pggt1bQ8BUY9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pggt1bQ8BUY9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Pggt1bQ8BUY9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pggt1bQ8BUY9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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