Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup54Q8BTS4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup54Q8BTS4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms