Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPB2

Gm5447, Predicted gene 5447, mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5447Q8BPB2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5447Q8BPB2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5447Q8BPB2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms