Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fbxo38Q8BMI0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxo38Q8BMI0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxo38Q8BMI0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxo38Q8BMI0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxo38Q8BMI0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxo38Q8BMI0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxo38Q8BMI0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxo38Q8BMI0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxo38Q8BMI0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxo38Q8BMI0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxo38Q8BMI0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxo38Q8BMI0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxo38Q8BMI0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxo38Q8BMI0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo38Q8BMI0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo38Q8BMI0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo38Q8BMI0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo38Q8BMI0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo38Q8BMI0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo38Q8BMI0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo38Q8BMI0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo38Q8BMI0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo38Q8BMI0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo38Q8BMI0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo38Q8BMI0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo38Q8BMI0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo38Q8BMI0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo38Q8BMI0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo38Q8BMI0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxo38Q8BMI0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms