Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn3Q8BHH8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Clrn3Q8BHH8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Clrn3Q8BHH8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Clrn3Q8BHH8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Clrn3Q8BHH8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Clrn3Q8BHH8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn3Q8BHH8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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