Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Vipas39Q8BGQ1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Vipas39Q8BGQ1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Vipas39Q8BGQ1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Vipas39Q8BGQ1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Vipas39Q8BGQ1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
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Vipas39Q8BGQ1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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